分居三年后，如果夫妻關系未能得以修復，就可以申請離婚。具體申請流程如下：

1. 準備資料：申請離婚需要準備夫妻雙方的身份證、結(jié)婚證、房產(chǎn)證、車輛證等相關證件，還需要提供離婚協(xié)議書和財產(chǎn)分割協(xié)議書。

2. 提交申請：將準備好的資料和協(xié)議書交到當?shù)氐拿裾郑f交書面離婚申請，并進行辦理手續(xù)。民政局會登記申請，雙方需要簽字確認協(xié)議內(nèi)容是否真實有效。

3. 等待裁決：通常情況下，民政局會開展一個調(diào)解期，以協(xié)助夫妻雙方就各項協(xié)議進行協(xié)商并對其進行審核。如果調(diào)解失敗，則會將申請?zhí)峤环ㄔ?，并?jīng)由權威機構(gòu)對協(xié)議進行審核與裁定。審核完成后，法院會對婚姻關系是否真實有效進行確認，并依據(jù)協(xié)議內(nèi)容予以裁決。

分居三年后過打算生活，離婚是一種正當合理的選擇。但離婚之前，夫妻雙方應該盡力協(xié)商和解決分歧，在離婚時平等地分割財產(chǎn)，并盡量保護子女的合法權益。